包皮过长本身不会直接影响肾脏功能，但如果长期不处理并发感染，可能通过尿路感染的途径间接影响泌尿系统健康，包括肾脏。

包茎或严重包皮过长会导致包皮垢积聚，为细菌提供理想滋生环境。这些细菌若上行感染，可能引起尿道炎，若不及时治疗，可能发展为膀胱炎，更严重时细菌可能逆行感染肾脏，引发肾盂肾炎。反复的肾脏感染可能损害肾功能，严重时可形成肾瘢痕。儿童期包茎若引起排尿困难(尿液呈"淋浴状"喷出)，长期可能影响上尿路发育。因此，虽然包皮过长不直接危害肾脏，但保持生殖器卫生十分重要。出现尿频、尿急、尿痛等症状时应及时就医，严重包茎或反复感染者可能需要手术治疗以预防并发症。